Учёные выявили потенциальные риски антибиотикорезистентности в промышленных пробиотиках

Международная группа исследователей представила подробный анализ фенотипических и генотипических профилей антибиотикорезистентности (AMR) у наиболее распространённых промышленных пробиотических штаммов: Enterococcus faecium, Bacillus licheniformis, Bacillus subtilis, Lactobacillus rhamnosus и Pediococcus acidilactici.

Тесты минимальной подавляющей концентрации (MIC) выявили устойчивость ряда штаммов к клинически важным антибиотикам, включая амоксициллин, гентамицин, клиндамицин, тилозин и флорфеникол. Результаты полногеномного секвенирования позволили идентифицировать 27 различных генов устойчивости, связанных с разнообразными механизмами защиты — от эффлюксных насосов и модификации мишеней до ферментов, инактивирующих антибиотики.

Особую обеспокоенность вызвал штамм Bacillus licheniformis, обладающий наиболее широким спектром генов устойчивости, включая множественные эффлюксные системы, ассоциированные с множественной лекарственной устойчивостью. В противоположность ему, у Pediococcus acidilactici не было обнаружено ни одного гена антибиотикорезистентности.

В большинстве случаев фенотипическая чувствительность коррелировала с генотипическими данными, однако отдельные расхождения указывают на возможное наличие скрытых или регулируемых механизмов устойчивости. Среди использованных инструментов биоинформатического анализа наиболее надёжные результаты показала программа ABRicate в сочетании с базой данных CARD, тогда как использование базы NCBI выявило наименьшее количество совпадений. Это подчёркивает критическую важность выбора базы данных при проведении геномного анализа AMR.

Исследователи отмечают, что даже пробиотики, считающиеся безопасными (GRAS), могут служить потенциальными резервуарами генов антибиотикорезистентности, особенно при их применении в пищевой цепочке.

«Наши результаты подчёркивают необходимость комплексного контроля пробиотических штаммов, включая тестирование на чувствительность in vitro и геномное профилирование. Только так можно гарантировать их безопасное использование в ветеринарии и пищевой промышленности», — заявили авторы исследования.

Работа выполнена в рамках концепции “Единое здоровье” (One Health), объединяющей усилия медицины, сельского хозяйства и экологии для борьбы с глобальным ростом антибиотикорезистентности.